Закончив работу, выберите Система → Выключить компьютер и в появившемся окне выберите Перезагрузить или Выключить. Через некоторое время система завершит работу и можно будет вынуть диск. Если ваш компьютер поддерживает ACPI, можете просто воспользоваться кнопкой выключения компьютера.